
<div style="line-height:1.7;color:#000000;font-size:14px;font-family:arial">&nbsp;


        <font face="Liberation Serif, serif"><font size="3"><span lang="en-US">Dear

Camino experts,&nbsp; </span></font></font>


        <style type="text/css">

        <!--

                @page { margin: 2cm }

                PRE.cjk { font-family: "文泉驿微米黑", monospace }

                PRE.ctl { font-family: "Lohit Hindi", monospace }

                P { margin-bottom: 0.21cm }

                A:link { so-language: zxx }

                CODE.cjk { font-family: "文泉驿微米黑", monospace }

                CODE.ctl { font-family: "Lohit Hindi", monospace }

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        </style>


<p style="margin-bottom: 0cm;"><font face="Liberation Serif, serif"><font size="3"><span lang="en-US"><code class="western"><font face="Liberation Serif, serif">I

am trying to generate a connectivity matrix using conmap.</font></code></span></font></font><font face="Liberation Serif, serif"><font size="3"><span lang="en-US"><code><br></code></span></font></font></p><p style="margin-bottom: 0cm;"><font face="Liberation Serif, serif"><font size="3"><span lang="en-US"><code></code>As the tutorial in the camino website mentioned, I typed the following</span></font></font>

<font face="Liberation Serif, serif"><font size="3"><span lang="en-US">command:</span></font></font>


<font face="Liberation Serif, serif"><font size="3"><span lang="en-US"><br></span></font></font></p><p style="margin-bottom: 0cm;"><font face="Liberation Serif, serif"><font size="3"><span lang="en-US">conmap -inputfile Tractography.Bdouble -roifile wm_undersampled.nii.gz</span></font></font>


<font face="Liberation Serif, serif"><font size="3"><span lang="en-US"><br></span></font></font></p><p style="margin-bottom: 0cm;"><font face="Liberation Serif, serif"><font size="3"><span lang="en-US">However, this command give the following message:</span></font></font>

<font face="Liberation Serif, serif"><font size="3"><span lang="en-US">"conmap: command not found</span></font></font> <font face="Liberation Serif, serif"><font size="3"><span lang="en-US">"<br></span></font></font></p><p style="margin-bottom: 0cm;"><font face="Liberation Serif, serif"><font size="3"><span lang="en-US">Is the command not in use now, or the connectivity can be done by other flag? What command should I use if I do want to obtain the connectivity map?</span></font></font></p><p style="margin-bottom: 0cm"><font face="Liberation Serif, serif"><font size="3"><span lang="en-US">Thanks so much for your kind help!<br></span></font></font></p>


</div><br><br><span title="neteasefooter"><span id="netease_mail_footer"></span></span>