<html><head><meta http-equiv="Content-Type" content="text/html charset=windows-1252"></head><body style="word-wrap: break-word; -webkit-nbsp-mode: space; -webkit-line-break: after-white-space;" class="">Hi,&nbsp;<div class=""><br class=""></div><div class="">Thank you for the help on this. I managed to fix the problem. It was indeed because I had upgraded the java runtime (JRE) but not the java SDK. When running "javac -version" it was still at 1.6.&nbsp;</div><div class=""><br class=""></div><div class="">When googling "download java for mac" the first result will be to download the JRE. If others are a in a similar bind, you want to download the JDK from here:&nbsp;<a href="http://www.oracle.com/technetwork/java/javase/downloads/index.html" class="">http://www.oracle.com/technetwork/java/javase/downloads/index.html</a></div><div class=""><br class=""></div><div class="">Thanks again!</div><div class="">Jason</div><div class=""><br class=""></div><div class=""><br class=""><div><blockquote type="cite" class=""><div class="">On Sep 8, 2015, at 10:41 AM, Philip A Cook &lt;<a href="mailto:cookpa@mail.med.upenn.edu" class="">cookpa@mail.med.upenn.edu</a>&gt; wrote:</div><br class="Apple-interchange-newline"><div class="">Hi,<br class=""><br class="">This problem happens on Java 6, I can't figure out why you would see it on Mavericks.<br class=""><br class="">Can you try<br class=""><br class=""> &nbsp;javac -version<br class=""><br class="">and see if it is the same as<br class=""><br class=""> java -version<br class=""><br class="">The compiler (javac) is what is complaining in the error message below. Occasionally these can be different if someone has installed separate versions, but usually on Macs this doesn't happen<br class=""><br class=""><br class="">On Sep 1, 2015, at 6:53 PM, Jason &lt;<a href="mailto:hubbard3@uoregon.edu" class="">hubbard3@uoregon.edu</a>&gt; wrote:<br class=""><br class=""><blockquote type="cite" class="">Hello, <br class=""><br class="">I’m trying to install the latest version of camnio. I’m running OSX 10.9 Mavericks, and I just updated java to version 1.8:<br class=""><br class="">java -version<br class="">java version "1.8.0_60"<br class="">Java(TM) SE Runtime Environment (build 1.8.0_60-b27)<br class="">Java HotSpot(TM) 64-Bit Server VM (build 25.60-b23, mixed mode)<br class=""><br class="">I downloaded the files via git, but when trying to run “make” it fails when trying to build AverageDWI and SelectShells:<br class=""><br class="">make<br class="">javac -classpath . apps/AddNoise.java<br class="">Note: Some input files use unchecked or unsafe operations.<br class="">Note: Recompile with -Xlint:unchecked for details.<br class="">javac -classpath . apps/BinaryToText.java<br class="">javac -classpath . apps/ClassifiedModelFit.java<br class="">javac -classpath . apps/ConnectivityMatrix.java<br class="">javac -classpath . apps/ConsistencyFraction.java<br class="">javac -classpath . apps/CountSeeds.java<br class="">javac -classpath . apps/DataStats.java<br class="">javac -classpath . apps/DeconvToCamenoFormat.java<br class="">javac -classpath . apps/DT_EigenSystem.java<br class="">javac -classpath . apps/DT_FitMatrix.java<br class="">javac -classpath . apps/DT_ShapeStatistics.java<br class="">javac -classpath . apps/DT_ToCamino.java<br class="">javac -classpath . apps/DT_ToImage.java<br class="">javac -classpath . apps/ElectrostaticSubsets.java<br class="">javac -classpath . apps/EntryPoint.java<br class="">./apps/AverageDWI.java:87: illegal start of type<br class=""> &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;List&lt;Integer&gt; includedMeasurements = new ArrayList&lt;&gt;();<br class=""> &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;^<br class="">./apps/SelectShells.java:110: illegal start of type<br class=""> &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;List&lt;Integer&gt; includedMeasurements = new ArrayList&lt;&gt;();<br class=""><br class="">I’m not a java person so I’m not sure what’s going on here. I noticed that both of these functions are missing details from the “Command Lists” page on the website so I’m assuming that they’re relatively new. <br class=""><br class="">Any help you could provide would be much appreciated!<br class=""><br class="">Best, <br class="">Jason<br class="">_______________________________________________<br class="">Camino-users mailing list<br class=""><a href="mailto:Camino-users@www.nitrc.org" class="">Camino-users@www.nitrc.org</a><br class="">http://www.nitrc.org/mailman/listinfo/camino-users<br class=""></blockquote><br class=""><br class=""></div></blockquote></div><br class=""></div></body></html>