Lynn<br><br>I have updated the MRtrix program <span style="font-family:courier new,monospace">tracks2prob</span> to enable calculation of the length-scaled TDI. You can get it at the <a href="https://code.google.com/p/mrtrix/source/browse/trunk/cmd/tracks2prob.cpp">MRtrix repository</a>
 where the most up-to-date code is kept (it should compile for MRtrix 
version 0.2.9, not 100% sure about earlier releases); otherwise if you 
wait for the next minor release of MRtrix (0.2.10) it should be included
 as part of the package.<br>
<br>Best of luck<br>
Rob<br clear="all"><br>--<br><br>Robert Smith<br>Melbourne Brain Centre<br>245 Burgundy Street<br>Heidelberg VIC 3084<br>Telephone: <a href="tel:%28%2B61%203%29%209035%207128" value="+61390357128" target="_blank">(+61 3) 9035 7128</a><br>
Fax: <a href="tel:%28%2B61%203%29%209035%207301" value="+61390357301" target="_blank">(+61 3) 9035 7301</a><br>Email:  <a href="mailto:r.smith@brain.org.au" target="_blank">r.smith@brain.org.au</a><br>
<a href="http://www.fni.edu.au" target="_blank">www.florey.edu.au</a>        <a href="http://www.brain.org.au" target="_blank">www.brain.org.au</a><br><span style="font-size:9pt;font-family:&quot;Times New Roman&quot;,&quot;serif&quot;;color:red"></span><br>


<br><br><div class="gmail_quote">On Fri, Dec 16, 2011 at 6:44 PM, 李佩霖 <span dir="ltr">&lt;<a href="mailto:lynnlee0226@gmail.com" target="_blank">lynnlee0226@gmail.com</a>&gt;</span> wrote:<br><blockquote class="gmail_quote" style="margin:0pt 0pt 0pt 0.8ex;border-left:1px solid rgb(204,204,204);padding-left:1ex">

Dear all,<br><br>I&#39;m trying to do the quantitative voxel-based anlysis. I have read the paper about length-scaled TDI (lsTDI) in NeuroImage 56, 1259-1266. I was wondering whether could I use MRtrix to generate the lsTDI.<br>


<br>Regrads<br>Lynn<br>
<br>_______________________________________________<br>
Mrtrix-discussion mailing list<br>
<a href="mailto:Mrtrix-discussion@www.nitrc.org" target="_blank">Mrtrix-discussion@www.nitrc.org</a><br>
<a href="http://www.nitrc.org/mailman/listinfo/mrtrix-discussion" target="_blank">http://www.nitrc.org/mailman/listinfo/mrtrix-discussion</a><br>
<br></blockquote></div><br>