<div dir="ltr">Hi hubs,<div><br></div><div>I am forwarding to you an email from Romain Valabregue re brainhack and the possibility to access local computational resources.<br></div><div><br></div><div><pre style="white-space:pre-wrap">
Hello Dear NeuroBureau

I am a research engineer in charge the CENIR data acquisition plateform 
at the ICM (paris).
Since I am also in charge of the computing resources (containing a small 
cluster of 400 nodes + 2 big openmp1 machine torque manager, nodes with 
centos6 ). I could also give access to several single server for 
individual computing.
The access could be donne for any labtop with the nxclient 
(<a href="http://www.nomachine.com/download.php" target="_blank">http://www.nomachine.com/download.php</a>)

Tel me if you will be interested so that I can think of the best way to 
achieve it. (my first idea was to give only a single account.)


About data Resources I already download the DTI and resting state data 
from the connectome project. So It will be
available. (40 sujbects HCP Q2 Release :( a very nice preprocessed High 
resolution data set) <a href="http://humanconnectome.org/data/" target="_blank">http://humanconnectome.org/data/</a>) there are also 
task fMRI data that I could download if needed



I am very interested to come to brainhack, but I hesitate to posted a 
project since I do not see any proposal.
there was several project in 2012 (C-PAC, fmri quality control, xnat 
...) that are of primary interest for my propose,
but I do not see neither what do they achieve nor if they will be 
present in 2013. Is it normal to do not see any project for this year ?

In short, my project idea was to propose 3 to 4 years of scaning raw 
data of our 3 T trio and Verio scanner and address the question of 
quality control in two directions : what are the bad data and what are 
the best data :
1_ Give quality indices of each data set and automatically detect 
artefact  (spykes, motions, background noise...)
2_ given the variability of acquisitions which parameters are the best 
(in term of SNR contrast ratio connectivity ...)
There is also a dimension of modality the procedure may be adapt for 
fMRI DWI and anatomical scan

There is a need of quality indices, a minimum of databasing to take care 
the variability of acquisitions, both integrated in a automatic 
framework that distribute job to the cluster resources. It seems to me 
that there are several solutions that are accessible today (even just 
looking at 2012 brainhack projects).

I only propose the data and the computing resources and my hope is that 
expert of those available solutions will take the challenge in the short 
time of the conference to process our 10 thousand exams. But I am not 
sure if this is a viable project and if they will find enough interest 
(time) to give a try...



Cheers

Romain Valabregue

CENIR, ICM
</pre></div><div><br></div><div><div></div>
</div></div>