Functions or variables 'nifti 'not recognized

jtbqz — Wed, 20 Apr 2022 4:05:43 GMT

when I just do the first step to import data,it warns Functions or variables 'nifti 'not recognized.

Can GRETNA be used to analyse EEG functional connectivity data?

Hsin-An Chang — Sun, 06 Feb 2022 12:29:01 GMT

Can GRETNA be used to analyse EEG functional connectivity data?

错误使用 gretna_GUI_PreprocessInterface>RunBtn_Callback (第 1006 行)

鹏程任 — Thu, 13 Jan 2022 2:54:28 GMT

你好，最近我使用GRETNA的时候，在相关性分析时出现严重报错。
================================ =================================================
 **** *****************************************
管道处理终止。
有关作业完成状态，请参阅下面的报告。
2022 年 1 月 13 日 10:34:47
****************************************** *****
以下作业的执行失败：

静态FC00001 ; 静态FC00002 ;
更多信息可以在各个日志文件中找到。使用以下命令显示这些日志：
psom_pipeline_visu('I:\ABIDE_BrainNet\5-8year\MAX\GretnaLogs\FunPreproAndNetCon\','log',JOB_NAME)
所有作业都已处理，但有些作业已失败。
如果您设法解决了问题，您可能希望
稍后重新启动管道。错误使用 gretna_GUI_PreprocessInterface>RunBtn_Callback (第 1006 行) 
\nASD077\nMATLAB 正在以无头模式运行。图形窗口将不显示。
è¦å'??: å??½æ??° iscolumn ä¸??æ????ä¸ª MATLAB å????ç½®å??½æ??°å????å?? ??ã????å»ºè®®æ??¨é????å'½å????è¯¥å??½æ??°ä»¥é??¿å???? æ½??å??¨ç????å????ç§°å??²çª??ã???? 
è¦å'??: å??½æ??° ismatrix ä¸??æ????ä¸ª MATLAB å????ç½®å??½æ??°å????å?? ??ã????å»ºè®®æ??¨é????å'½å????è¯¥å??½æ??°ä»¥é??¿å???? æ½??å??¨ç????å????ç§°å??²çª??ã???? 
è¦å'??: å??½æ??° isrow ä¸??æ????ä¸ª MATLAB å????ç½®å??½æ??°å????å?? ??ã????å»ºè®®æ??¨é????å'½å????è¯¥å??½æ??°ä»¥é??¿å???? æ½??å??¨ç????å????ç§°å??²çª??ã????
è¦å'??: å??½æ??° narginchk ä¸??æ????ä¸ª MATLAB å????ç½®å??½æ??°å????å?? ??ã????å»ºè®®æ??¨é????å'½å????è¯¥å??½æ??°ä»¥é??¿å???? æ½??å??¨ç????å????ç§°å??²çª??ã???? 
è¦å'??: å??½æ??° isequaln ä¸??æ????ä¸ª MATLAB å????ç½®å??½æ??°å????å?? ??ã????å»ºè®®æ??¨é????å'½å????è¯¥å??½æ??°ä»¥é??¿å???? æ½??å??¨ç????å????ç§°å??²çª??ã????
è¦??å¼??å§??ï¼??è¯·é"®å??¥ docã???? 
æ????å??³äº§å"??ä¿¡æ??¯ ï¼??è¯·è®¿é??® www.mathworks.comã????
è¦å'??: psom:default: 以下字段在结构作业中被忽略：OutputImgFile 
> ä½??ç½®ï¼??psom_set_defaults (ç¬¬ 101 è¡??) 
ä½??ç½® : psom_run_job (ç¬¬ 111 è¡??)
****************************** 
(matlab) 作业的日志：StaticFC00001
开始于 2022 年 1 月 13 日 10:34： 42
用户：MeltDown
主机：未知
系统：windows 
******************************
作业现在开始！
********************
********************
出了点问题……工作失败了！
最后出现的错误消息是：
é??»è¾'ç´¢å¼??å????å??«ä¸??ä¸ªè¶??å??ºæ??°ç»??è ????å??´ç???? 真的 å??¼ã???? 
文件 K:\GRETNA_2.0.0_release_20171121\RunFun\gretna_RUN_StaticFC.m 第 118 行
文件 K:\GRETNA_2.0.0_release_20171121\RunFun\gretna_RUN_StaticFC.m 第 45 行
文件 K:\GRETNA_2.0.0_release_20171121\RunFun\gretna_RUN_Stat 45
文件 K:\GRETNA_2.0.0_release_20171121\PSOM\psom_run_job.m 第 214 行
文件 K:\GRETNA_2.0.0_release_20171121\PSOM\psom_run_job.m 第 128 行
******************
检查输出
****************
输出文件或目录 I:\ABIDE_BrainNet\5-8year\MAX\ GretnaSFCMatrixR\rASD077.txt 尚未生成！
输出文件或目录 I:\ABIDE_BrainNet\5-8year\MAX\GretnaTimeCourse\ASD077.txt 尚未生成！
************************************************ 1
月13日- 2022 10:34:43：作业已失败
用于处理作业的总时间：1.00 秒。
************************************************
答案=
合乎逻辑的
1
\nTD085\nMATLAB 正在无头模式下运行。图形窗口将不显示。
è¦å'??: å??½æ??° iscolumn ä¸??æ????ä¸ª MATLAB å????ç½®å??½æ??°å????å?? ??ã????å»ºè®®æ??¨é????å'½å????è¯¥å??½æ??°ä»¥é??¿å???? æ½??å??¨ç????å????ç§°å??²çª??ã???? 
è¦å'??: å??½æ??° ismatrix ä¸??æ????ä¸ª MATLAB å????ç½®å??½æ??°å????å?? ??ã????å»ºè®®æ??¨é????å'½å????è¯¥å??½æ??°ä»¥é??¿å???? æ½??å??¨ç????å????ç§°å??²çª??ã???? 
è¦å'??: å??½æ??° isrow ä¸??æ????ä¸ª MATLAB å????ç½®å??½æ??°å????å?? ??ã????å»ºè®®æ??¨é????å'½å????è¯¥å??½æ??°ä»¥é??¿å???? æ½??å??¨ç????å????ç§°å??²çª??ã???? 
è¦å'??: å??½æ??° narginchk ä¸??æ????ä¸ª MATLAB å????ç½®å??½æ??°å????å?? ??ã????å»ºè®®æ??¨é????å'½å????è¯¥å??½æ??°ä»¥é??¿å???? æ½??å??¨ç????å????ç§°å??²çª??ã???? 
è¦å'??: å??½æ??° isequaln ä¸??æ????ä¸ª MATLAB å????ç½®å??½æ??°å????å?? ??ã????å»ºè®®æ??¨é????å'½å????è¯¥å??½æ??°ä»¥é??¿å???? æ½??å??¨ç????å????ç§°å??²çª??ã????
è¦??å¼??å§??ï¼??è¯·é"®å??¥ docã???? 
æ????å??³äº§å"??ä¿¡æ??¯ ï¼??è¯·è®¿é??® www.mathworks.comã????
è¦å'??: psom:default: 以下字段在结构作业中被忽略：OutputImgFile 
> ä½??ç½®ï¼??psom_set_defaults (ç¬¬ 101 è¡??) 
ä½??ç½® : psom_run_job (ç¬¬ 111 è¡??)
****************************** 
（matlab）作业的日志：StaticFC00002
开始于 2022 年 1 月 13 日 10:34： 42
用户：MeltDown
主机：未知
系统：windows 
******************************
作业现在开始！
********************
********************
出了点问题……工作失败了！
最后出现的错误消息是：
é??»è¾'ç´¢å¼??å????å??«ä¸??ä¸ªè¶??å??ºæ??°ç»??è ????å??´ç???? 真的 å??¼ã???? 
文件 K:\GRETNA_2.0.0_release_20171121\RunFun\gretna_RUN_StaticFC.m 第 118 行
文件 K:\GRETNA_2.0.0_release_20171121\RunFun\gretna_RUN_StaticFC.m 第 45 行
文件 K:\GRETNA_2.0.0_release_20171121\RunFun\gretna_RUN_Stat 45
文件 K:\GRETNA_2.0.0_release_20171121\PSOM\psom_run_job.m 第 214 行
文件 K:\GRETNA_2.0.0_release_20171121\PSOM\psom_run_job.m 第 128 行
******************
检查输出
****************
输出文件或目录 I:\ABIDE_BrainNet\5-8year\MAX\ GretnaSFCMatrixR\rTD085.txt 尚未生成！
输出文件或目录 I:\ABIDE_BrainNet\5-8year\MAX\GretnaTimeCourse\TD085.txt 尚未生成！
************************************************ 1
月13日- 2022 10:34:43：作业已失败
用于处理作业的总时间：0.92 秒。
************************************************
答案=
合乎逻辑的
1
出错 gui_mainfcn (第 95 行) 
feval(varargin{:});
出错 gretna_GUI_PreprocessInterface (第 42 行) 
gui_mainfcn(gui_State, varargin{:});
出错 matlab.graphics.internal.figfile.FigFile/read>@(hObject,eventdata)gretna_GUI_PreprocessInterface('RunBtn_Callback',hObject,eventdata,guidata(hObject))
计算 UIControl Callback 时出错。

RE: errror while launching GRETNA

Elmira Hassanzadeh — Fri, 24 Dec 2021 1:15:21 GMT

Hi,

make sure when setting the path on Matlab, you select "add with subforlders" and not just "add folder".

Best,
Elmira

about GRETNA

Zhang Shan — Fri, 17 Dec 2021 15:37:21 GMT

Hello, teacher, I now use Gretna to make a dynamic matrix. After that, I want to use the dynamic matrix separating each state to make global & local efficiency. How do I realize clustering and state division in Gretna.

Modular interaction

Yong Hun Jang — Mon, 15 Nov 2021 7:59:50 GMT

hello

Here, we are looking for the parameters of within module in the structurally connected network. Other studies appear to use within module z-score as an indicator.

I wonder if the result of modular interaction through the gretna GUI is the same as the within module z score.

If not, I'm curious where the equations and references of within and between modular interaction come from.

RE: questions about network analysis using gretna

Ozgun Ozalay — Sun, 24 Oct 2021 21:29:46 GMT

Did you try replacing NaNs with 0 (zeros) ?

You can easily do this on multidimensional arrays in Matlab with th following command, just replace Z with your matrix variable:

[b]Z(isnan(Z)) = 0[/b]

Hope it helps!
./OZ*

RE: errror while launching GRETNA

yemishade22 — Wed, 13 Oct 2021 2:27:54 GMT

[i]Originally posted by yemishade22:[/i][quote]Could anyone help out on resolving the same issue? I am facing similar problem right away. Thanks[/quote][color=#000000]I found out that wrong installation of GRETNA led to the above error message. Once, the installation procedure given in the manual is strictly followed, there wont be any reason to have the error. Thanks[/color]

RE: errror while launching GRETNA

yemishade22 — Wed, 13 Oct 2021 2:12:10 GMT

Could anyone help out on resolving the same issue? I am facing similar problem right away. Thanks

community index

niu jinpeng — Fri, 28 May 2021 10:08:02 GMT

I want to use the FC matrix to calculate the Nodal-Participant Coefficient and Modular-Interaction, what should be entered into the Community Index?

NITRC GRETNA Forum: help

Functions or variables 'nifti 'not recognized

Can GRETNA be used to analyse EEG functional connectivity data?

错误使用 gretna_GUI_PreprocessInterface>RunBtn_Callback (第 1006 行)

RE: errror while launching GRETNA

about GRETNA

Modular interaction

RE: questions about network analysis using gretna

RE: errror while launching GRETNA

RE: errror while launching GRETNA

community index