Execution Options
MethodOption 
Download and run 
 IIT_Atlas_v.5.0_MANUAL.pdf 
 IIT_bundles_256.zip 
 IIT_bundles_skeletonized_256.zip 
 IIT_bundles_skeletonized.zip 
 IIT_bundles.zip 
 IIT_connectivity_matrix.txt 
 IIT_correlation_256.nii.gz 
 IIT_correlation.nii.gz 
 IIT_CSF_tissue_prob_256.nii.gz 
 IIT_CSF_tissue_prob.nii.gz 
 IITcv_t1_256.nii.gz 
 IITcv_t1.nii.gz 
 IIT_fornix_fixed_5tt_file_for_ACT_tractography_256.nii.gz 
 IIT_fornix_fixed_5tt_file_for_ACT_tractography.nii.gz 
 IIT_GFA_256.nii.gz 
 IIT_GFA.nii.gz 
 IIT_GM_Desikan_atlas_256.nii.gz 
 IIT_GM_Desikan_atlas.nii.gz 
 IIT_GM_Desikan_confidence_256.nii.gz 
 IIT_GM_Desikan_confidence.nii.gz 
 IIT_GM_Desikan_mask_256.nii.gz 
 IIT_GM_Desikan_mask.nii.gz 
 IIT_GM_Desikan_prob_256.nii.gz 
 IIT_GM_Desikan_prob.nii.gz 
 IIT_GM_Destrieux_atlas_256.nii.gz 
 IIT_GM_Destrieux_atlas.nii.gz 
 IIT_GM_Destrieux_confidence_256.nii.gz 
 IIT_GM_Destrieux_confidence.nii.gz 
 IIT_GM_Destrieux_mask_256.nii.gz 
 IIT_GM_Destrieux_mask.nii.gz 
 IIT_GM_Destrieux_prob_256.nii.gz 
 IIT_GM_Destrieux_prob.nii.gz 
 IIT_GM_tissue_prob_256.nii.gz 
 IIT_GM_tissue_prob.nii.gz 
 IIT_HARDI_256.nii.gz 
 IIT_HARDI.nii.gz 
 IIT_HARDI_tractogram_256.tck 
 IITmean_b0_256.nii.gz 
 IITmean_b0.nii.gz 
 IITmean_colormap_256.tif 
 IITmean_colormap.tif 
 IITmean_cou_256.nii.gz 
 IITmean_cou.nii.gz 
 IITmean_dw_256.nii.gz 
 IITmean_dw.nii.gz 
 IITmean_FA_256.nii.gz 
 IITmean_FA.nii.gz 
 IITmean_FA_skeleton_256.nii.gz 
 IITmean_FA_skeleton.nii.gz 
 IITmean_fastd_256.nii.gz 
 IITmean_fastd.nii.gz 
 IITmean_L1_256.nii.gz 
 IITmean_L1.nii.gz 
 IITmean_L2_256.nii.gz 
 IITmean_L2.nii.gz 
 IITmean_L3_256.nii.gz 
 IITmean_L3.nii.gz 
 IITmean_lower_cingulum_256.nii.gz 
 IITmean_lower_cingulum.nii.gz 
 IITmean_t1_256.nii.gz 
 IITmean_t1.nii.gz 
 IITmean_tensor_256.nii.gz 
 IITmean_tensor_mask_256.nii.gz 
 IITmean_tensor.nii.gz 
 IITmean_tr_256.nii.gz 
 IITmean_tr.nii.gz 
 IITmean_trstd_256.nii.gz 
 IITmean_trstd.nii.gz 
 IITmean_tvdt_scl_256.nii.gz 
 IITmean_tvdt_scl.nii.gz 
 IITmean_V1_256.nii.gz 
 IITmean_V1.nii.gz 
 IITmean_V2_256.nii.gz 
 IITmean_V2.nii.gz 
 IITmean_V3_256.nii.gz 
 IITmean_V3.nii.gz 
 IITmean_xx_256.nii.gz 
 IITmean_xx.nii.gz 
 IITmean_yx_256.nii.gz 
 IITmean_yx.nii.gz 
 IITmean_yy_256.nii.gz 
 IITmean_yy.nii.gz 
 IITmean_zx_256.nii.gz 
 IITmean_zx.nii.gz 
 IITmean_zy_256.nii.gz 
 IITmean_zy.nii.gz 
 IITmean_zz_256.nii.gz 
 IITmean_zz.nii.gz 
 IITmedian_colormap_256.tif 
 IITmedian_colormap.tif 
 IITmedian_cou_256.nii.gz 
 IITmedian_cou.nii.gz 
 IITmedian_FA_256.nii.gz 
 IITmedian_FA.nii.gz 
 IITmedian_fastd_256.nii.gz 
 IITmedian_fastd.nii.gz 
 IITmedian_L1_256.nii.gz 
 IITmedian_L1.nii.gz 
 IITmedian_L2_256.nii.gz 
 IITmedian_L2.nii.gz 
 IITmedian_L3_256.nii.gz 
 IITmedian_L3.nii.gz 
 IITmedian_tr_256.nii.gz 
 IITmedian_tr.nii.gz 
 IITmedian_trstd_256.nii.gz 
 IITmedian_trstd.nii.gz 
 IITmedian_tvdt_scl_256.nii.gz 
 IITmedian_tvdt_scl.nii.gz 
 IITmedian_V1_256.nii.gz 
 IITmedian_V1.nii.gz 
 IITmedian_V2_256.nii.gz 
 IITmedian_V2.nii.gz 
 IITmedian_V3_256.nii.gz 
 IITmedian_V3.nii.gz 
 IITmedian_xx_256.nii.gz 
 IITmedian_xx.nii.gz 
 IITmedian_yx_256.nii.gz 
 IITmedian_yx.nii.gz 
 IITmedian_yy_256.nii.gz 
 IITmedian_yy.nii.gz 
 IITmedian_zx_256.nii.gz 
 IITmedian_zx.nii.gz 
 IITmedian_zy_256.nii.gz 
 IITmedian_zy.nii.gz 
 IITmedian_zz_256.nii.gz 
 IITmedian_zz.nii.gz 
 IITstd_t1_256.nii.gz 
 IITstd_t1.nii.gz 
 IIT_TDI_256.zip 
 IIT_TDI_sum_256.nii.gz 
 IIT_TDI_sum.nii.gz 
 IIT_TDI_sum_skeletonized_256.nii.gz 
 IIT_TDI_sum_skeletonized.nii.gz 
 IIT_TDI.zip 
 IIT_WM_atlas_256.nii.gz 
 IIT_WM_atlas_60_top_layers_256.zip 
 IIT_WM_atlas_60_top_layers_skeletonized_256.zip 
 IIT_WM_atlas_60_top_layers_skeletonized.zip 
 IIT_WM_atlas_60_top_layers.zip 
 IIT_WM_atlas_confidence_256.nii.gz 
 IIT_WM_atlas_confidence_60_top_layers_256.zip 
 IIT_WM_atlas_confidence_60_top_layers_skeletonized_256.zip 
 IIT_WM_atlas_confidence_60_top_layers_skeletonized.zip 
 IIT_WM_atlas_confidence_60_top_layers.zip 
 IIT_WM_atlas_confidence.nii.gz 
 IIT_WM_atlas_confidence_skeletonized_256.nii.gz 
 IIT_WM_atlas_confidence_skeletonized.nii.gz 
 IIT_WM_atlas_length_256.nii.gz 
 IIT_WM_atlas_length.nii.gz 
 IIT_WM_atlas.nii.gz 
 IIT_WM_atlas_skeletonized_256.nii.gz 
 IIT_WM_atlas_skeletonized.nii.gz 
 IIT_WM_tissue_prob_256.nii.gz 
 IIT_WM_tissue_prob.nii.gz 
 label_probabilities_Desikan_256.zip 
 label_probabilities_Desikan.zip 
 label_probabilities_Destrieux_256.zip 
 label_probabilities_Destrieux.zip 
 LUT_Connectome_Nodes.txt 
 LUT_GM_Desikan_0to1.txt 
 LUT_GM_Desikan_0to255.txt 
 LUT_GM_Destrieux_0to1.txt 
 LUT_GM_Destrieux_0to255.txt 
 LUT_WM_0to1.txt 
 LUT_WM_0to255.txt 
 regionconnect.py 
 tbss_3_postreg_iit 
 tbss_3_postreg_iit_256 
 tbss_4_prestats_iit 
 tbss_4_prestats_iit_256 
 tbss_non_FA_iit 
 tbss_non_FA_iit_256